Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smg8Q8VE18 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms