Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Dnajc28Q8VCE1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms