Protein–RNA interactions for Protein: Q8R574

Prpsap2, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap2Q8R574 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prpsap2Q8R574 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpsap2Q8R574 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms