Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc12Q8R344 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms