Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg10Q8R1P4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg10Q8R1P4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms