Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Casc3Q8K3W3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms