Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot6Q8K3P5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnot6Q8K3P5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms