Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
OptnQ8K3K8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
OptnQ8K3K8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms