Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vrk3Q8K3G5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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