Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nsl1Q8K305 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nsl1Q8K305 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms