Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccm2Q8K2Y9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms