Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf219Q8K2Y0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf219Q8K2Y0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms