Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Scara5Q8K299 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scara5Q8K299 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms