Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtf3c1Q8K284 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf3c1Q8K284 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms