Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Neil3Q8K203 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Neil3Q8K203 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms