Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sde2Q8K1J5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sde2Q8K1J5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms