Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TwnkQ8CIW5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms