Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Card11Q8CIS0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms