Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CopaQ8CIE6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CopaQ8CIE6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms