Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Clip4Q8CI96 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Clip4Q8CI96 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Clip4Q8CI96 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Clip4Q8CI96 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Clip4Q8CI96 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clip4Q8CI96 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Clip4Q8CI96 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Clip4Q8CI96 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Clip4Q8CI96 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Clip4Q8CI96 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Clip4Q8CI96 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clip4Q8CI96 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms