Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ep400Q8CHI8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ep400Q8CHI8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms