Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tshz3Q8CGV9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tshz3Q8CGV9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms