Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFU8

Tp53inp2, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53inp2Q8CFU8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tp53inp2Q8CFU8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms