Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Setd1bQ8CFT2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd1bQ8CFT2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms