Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx8Q8CFD4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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