Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lancl3Q8CD19 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lancl3Q8CD19 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms