Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb1Q8CBF3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms