Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nrip1Q8CBD1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nrip1Q8CBD1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms