Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slfn5Q8CBA2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms