Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Fbxo48Q8CAT8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fbxo48Q8CAT8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms