Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfrp1Q8C4U3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sfrp1Q8C4U3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sfrp1Q8C4U3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sfrp1Q8C4U3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sfrp1Q8C4U3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sfrp1Q8C4U3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms