Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hdac7Q8C2B3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms