Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trub1Q8C0D0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms