Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Snx16Q8C080 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Snx16Q8C080 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx16Q8C080 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx16Q8C080 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx16Q8C080 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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