Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn17Q8BXA6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms