Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Usp38Q8BW70 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp38Q8BW70 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp38Q8BW70 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms