Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zfp398Q8BV16 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Zfp398Q8BV16 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms