Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cops7bQ8BV13 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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