Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cxcl16Q8BSU2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Cxcl16Q8BSU2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cxcl16Q8BSU2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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