Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bicd1Q8BR07 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms