Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnpy4Q8BQ47 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnpy4Q8BQ47 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms