Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem260Q8BMD6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms