Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tarsl2Q8BLY2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms