Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gpc2Q8BKV1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpc2Q8BKV1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms