Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms