Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Nop53Q8BK35 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nop53Q8BK35 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Nop53Q8BK35 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nop53Q8BK35 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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