Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ71

Nup93, Nuclear pore complex protein Nup93, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup93Q8BJ71 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nup93Q8BJ71 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup93Q8BJ71 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms