Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rufy1Q8BIJ7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms