Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8BGC1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Q8BGC1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8BGC1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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