Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trmt12Q8BG71 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trmt12Q8BG71 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms